Создатели ожидали, что самолет будет востребован во всем мире, но в процессе эксплуатации лайнера возникла масса проблем.
Сначала армянская авиакомпания Armavia, а вслед за ней и ряд других авиакомпаний из разных стран мира стали отказываться от готовых самолетов Sukhoi Superjet-100. Причины отказов: постоянные поломки лайнера, а также невыполнение условий гарантийного обслуживания со стороны производителя.
В мае 2012 года во время демонстрационного полета в Индонезии Sukhoi Superjet-100 разбился. Погибли 45 пассажиров и экипаж.